A biodiversidade da ilha da Boa Vista é caracterizada pela existência de
várias comunidades de fauna e flora representativas dos ecossistemas costeiros
e marinhos de Cabo Verde, da qual se destaca a Tartaruga-Comum (Caretta caretta) que aqui tem a sua
principal área de desova em Cabo Verde.
A vegetação costeira inclui Malpica (Sporobolus
spicatus), Cakile maritima, Sesuvium sesuvioides, Murraça-Branca (Zygophyllum fontanesii) e
Matinho-de-Água (Z. simplex), sendo
que as espécies mais representativas nas áreas lagunares são Murraçona (Arthrocnemum glaucum), Murraça-Preta (Suaeda vermiculata), Murraça-Branca (Z. fontanesii), Sporobolus minutus, Malpica (S.
spicatus) e Junça (Cyperus bulbosus).
A avifauna inclui Borrelho-de-Coleira (Charadrius alexandrinus), Pernalonga (Himantopus himantopus), Rola-do-Mar (Arenaria interpres), Tarambola-Cinzenta (Pluvialis squatarola), Perna-Verde (Tringa nebularia), Garça-Real (Ardea
cinérea), Garça-Branca (Egretta
garzetta), Garça-Boeira (Bubulcus
íbis), Colhereiro (Platalea
leucorodia), Guincho (Pandion
haliaetus), Rabil (Fregata
magnificens), Cagarra (Calonectris
edwardsii), Alcatraz (Sula
leucogaster), Rabo-de-Junco (Phaethon
aethereus), Pedreiro-azul ou Painho-de-ventre-branco (Pelagodroma marina) e Jabe-jabe ou Pedreirinho (Oceanodroma castro).
As comunidades de corais ao longo da costa da ilha da Boa Vista,
nomeadamente no ilhéu de Sal Rei e na baía das Gatas são das mais
diversificadas e abundantes de todo o território de Cabo Verde. As espécies do
género Conus apresentam uma elevada diversidade e um elevado grau de endemismo.
Várias espécies de tubarões e peixes pelágicos bem como mamíferos marinhos, nomeadamente
a Baleia-de-bossa (Megaptera novaeangliae)
se reproduzem nas águas costeiras da Boa Vista.